本論就「起信論」的因緣分、立義分、解釋分、修行信心分、勸修利益分等分，解釋其意。於立義分開立三十三種法門，大別為修行種因海與性德圓滿海，以對辨其深淺。第十卷性德圓滿的思想，與密教極為一致，日本弘法大師空海即依此論發揮真言教義。

本論的注疏很多，重要的有五，如下：
(一)「釋摩訶衍論記」一卷。唐代沙門聖法鈔。
(二)「釋摩訶衍論疏」六卷。唐代沙門法敏集。
(三)「釋摩訶衍論贊玄疏」五卷。遼沙門法悟撰。
(四)「釋摩訶衍論記」六卷。宋代沙門普觀述。
(五)「釋摩訶衍論通玄鈔」四卷。宋代沙門玄福撰。